1994 yılına Rahmi Koç’un desteğiyle kurulan ve Haliç’in kıyısında ve toplam 27.000 m²lik bir alanı kaplayan müze üç ana bölümden oluşmaktadır. Müzede Atatürk koleksiyonun yanı sıra feribot, gemi, uçak, denizaltı, lokomotif ve tramvay modelleri gibi gerçek boyutlarda binlerce obje ziyaretçilere sergilenmektedir.
